Zuckerberg dévoile un atlas d’un milliard de protéines pour accélérer les médicaments
Un atlas géant, qualifié de « carte du vivant moléculaire », a été développé par les chercheurs du BioHub. Cet outil permettra de naviguer à travers des milliards de protéines différentes, avec l’objectif d’accélérer l’identification de nouveaux médicaments. Selon le BioHub, un institut biomédical de la Chan Zuckerberg Initiative, cet atlas pourrait « ouvrir une nouvelle voie aux chercheurs pour concevoir des protéines et accélérer les découvertes scientifiques ».
L’initiative n’est pas sans précédent. En 2021, DeepMind et l’Institut européen de bio-informatique avaient créé AlphaFold, qui couvre actuellement 200 millions de structures protéiques. Toutefois, l’annonce du BioHub représente un progrès significatif par rapport à AlphaFold.
La base de données, nommée ESM Atlas, a été générée grâce à un puissant modèle d’intelligence artificielle, ESMFold2, entraîné à partir de données de séquences biologiques collectées au fil des décennies. Ce modèle a permis de générer plus d’un milliard de structures protéiques en 3D et des milliards de séquences supplémentaires, y compris celles d’espèces jamais cultivées ou décrites.
Actuellement, la découverte d’une nouvelle molécule thérapeutique prend généralement entre 10 et 15 ans. Avec cet atlas, les chercheurs pourraient identifier plus rapidement des protéines impliquées dans des maladies et concevoir de nouvelles molécules capables de se fixer sur des cibles biologiques. L’ESM Atlas sera également accessible gratuitement aux chercheurs du monde entier, ce qui en fait un outil open source.
Selon un communiqué publié dans Nature, BioHub a déjà validé certaines de ses prédictions sur des cibles liées au cancer et aux maladies immunitaires.
Cette avancée pourrait permettre de concevoir des protéines pour des applications variées, telles que des enzymes industrielles ou des anticorps thérapeutiques, et faciliter la découverte de nouvelles familles protéiques. Cependant,
Source : BioHub, Nature
